Die BAW als technisch-wissenschaftliche Bundesoberbehörde im Geschäftsbereich des Bundesministeriums für Verkehr, Bau und Stadtentwicklung berät und unterstützt die Dienststellen der Wasser- und Schifffahrtsverwaltung auf dem Gebiet des Verkehrswasserbaus und trägt wesentlich dazu bei, dass die Wasserstraßen in Deutschland den wachsenden technischen, wirtschaftlichen und ökologischen Anforderungen gerecht werden. Mit ihrer umfassenden Expertise ist die BAW eine national und international anerkannte Institution und maßgeblich an der Weiterentwicklung des Verkehrswasserbaus beteiligt.
Als eine ihrer Kernaufgaben führt die BAW Forschungsvorhaben mit dem Ziel durch, die eigene Beratungsleistung stetig zu verbessern und auszubauen sowie der Wasser- und Schifffahrtsverwaltung des Bundes innovative, sichere und wirtschaftliche Instrumente und Methoden für den Betrieb und die Entwicklung des Wasserstraßen zur Verfügung zu stellen.