Die Ressortforschungseinrichtungen werden regelmäßig vom Wissenschaftsrat anhand eines umfassenden Kriterienkatalogs, dem Leitfaden für die institutionelle Evaluation von Einrichtungen mit Ressortforschungsaufgaben des Bundes 
(Drs.1010-23), Januar 2023 begutachtet.

Die an die zuständigen Ressorts und die Einrichtungen gerichteten Stellungnahmen werden über die Website des  Wissenschaftsrats unter Publikationen veröffentlicht.